Сезон начинается с того, что Эллиот Алдерсон, талантливый, но страдающий социофобией и депрессией кибербезопасник, работает в компании Allsafe. Его привлекает таинственная хакерская группа fsociety, возглавляемая загадочным Мистером Роботом. Мистер Робот убеждает Эллиота помочь в грандиозном плане — уничтожить долговые записи крупнейшей корпорации E Corp. Эллиот постепенно погружается в мир подпольного хакерства, сталкиваясь с моральными дилеммами. Параллельно он проходит психотерапию у доктора Кристы, которая помогает ему разобраться в своем прошлом. Эллиот обнаруживает, что его отец умер от лейкемии, но истина оказывается сложнее: он выясняет, что Мистер Робот — это его собственное второе Я, созданное в результате психической травмы.
Параллельно с этим Эллиот расследует дело об утечке данных в Allsafe, что приводит его к конфликту с коррумпированным CEO E Corp Тайреллом Уэлликом. Тайрелл, стремясь к власти, вступает в сговор с fsociety. В финале сезона Эллиот и fsociety проводят масштабную атаку на серверы E Corp, уничтожая все долговые записи. Однако триумф омрачен: Эллиот понимает, что его личность расколота, и он сам является Мистером Роботом. Сезон заканчивается шокирующим открытием — Эллиот узнает, что его отец на самом деле жив и является Мистером Роботом, но это также может быть галлюцинацией. Тем временем Тайрелл, убив свою жену, пытается связаться с Мистером Роботом, что задает тон следующему сезону.
